Název předmětu: Biomedicínské modely v informatice
Ústav: 445 - Ústav počítačové a řídicí techniky
Přednášející: Doc. Ing. Jaromír Kukal, CSc
Zástupce: MUDr Oldřich Vyšata
Typ předmětu: povinně volitelný
Rozsah / zakončení: 2/1 kz
Kredity 3
Doporučený ročník / semestr: 2/3
Povinné předcházející předměty:  
   
Doporučené předcházející předměty: Číslicové zpracování signálů a obrazů
  Biologické signály 
Souhrn:  
Předmět zahrnuje vybrané metody modelování biomedicínských dat a jejich analýzy s využitím příslušných informačních systémů. Vlastní tématika zahrnuje popis pořizování a analýzy  vícekanálových biomedicínských dat a obrazů s jejich následným modelováním. Těžiště předmětu je v  matematickém zpracování dat a ve fundovaném posouzení výsledků. Umožňuje tak studentům sjednocující pohled na zpracování biodat z inženýrského, biomedicínského a matematického hlediska s využitím prostředků výpočetní techniky a databázových systémů pro třídění informací.   
 
 Anotace:  
1 Pořizování a vlastnosti vybraných biomedicínských dat, výběr informací, stacionarita
2 Matematické metody zpracování biodat, artefakty, potlačování rušivých složek
3 Databázové prostředky záznamu biomedicínských informací, přenos dat, integrované systémy
4 Analýza a modelování EKG. Komprese a přenos EKG.
5 Modelování elektrické aktivity neuronu. Funkční MR. 
6 Lineární a nelineární modely EEG. Matematické modelování neuronů.
7 Modelování komunikace v biomedicínských objektech: neurony, svaly 
8 Statistické metody analýzy biomedicínských dat, korelace, spolehlivost
9 Modelování evokovaných potenciálů a sumačních akčních svalových potenciálů. Pronyho metoda.
10 Chaos a dynamická analýza biologických signálů
11 Analýza textur v ultrazvukové diagnostice, základní algoritmy
12 Výběr příznaků biomedicínských dat, metody klasifikace, posuzování 
13 Třírozměrné modelování magnetickorezonanční a CT angiografie
14 Biomedicínské informační systémy, representace znalostí
 
 Literatura:  
[1] Reddy D.C.: Biomedical Signal Processing – Principles and Techniques, McGraw Hill, 2005
[2] Weitkunat R.: Digital Biosignal Processing, Elsevier, 1991
[3] Drongelen W., Signal Processing for Neuroscientists: An Introduction to the Analysis of Physiological Signals, Elsevier, 2007
[4] Izhikevich E. M., Dynamical Systems in Neuroscience: The Geometry of Excitability and Bursting (Computational Neuroscience), The MIT Press, 2007